Пневмоцистоз є грибковою інвазією, що належить до системних мікозів. Це паразитарна інвазія, тобто хвороба, спричинена паразитами, і також вважається інфекційною хворобою. Зараження може відбуватися активно (коли паразит проникає через пошкоджені та непошкоджені шкірні покрови) або пасивно (коли паразит вноситься в організм з водою чи їжею).
Пневмоцистоз спричинюється паразитичними грибками.