Розщеплення піднебіння – це розщеплення в середній частині піднебіння, яке виникає через те, що дві половини піднебіння не зрослися під час розвитку дитини в утробі матері. Це може стосуватися лише частини піднебіння (наприклад, м'якого піднебіння або язичка) або ж проходити по всій довжині, поєднуючись з розщепленням у передній частині верхньої щелепи. Часто такі діти народжуються також з розщепленням губи, що називається «заячою губою».
Розщеплення в середній частині піднебіння. Може бути уражена лише частина піднебіння (наприклад, тільки м'яке піднебіння або язичок піднебіння), або ж розщеплення може проходити по всій довжині, поєднуючись з білатеральним розщепленням в передній частині верхньої щелепи. Нерідко такі діти народжуються з розщепленням губи – «заячою губою».
У більшості випадків причина – спадковість. Факторами ризику вважаються вживання алкоголю, куріння та вік матері (пологи після 35 років). Розщеплення верхньої губи та піднебіння виникає в перші два місяці вагітності, коли формуються щелепно-лицьові органи. Це є різновидом алкогольної ембріопатії. Ген GAD1 асоційований з ризиком патології в японській популяції.